| TAMS23 |
Statistiska metoder i bioinformatik, 4 p
/Statistical Methods in Bioinformatics/ |
||
Prel. schemalagd
tid: 48 |
|||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Matematik Nivå (A-D):C |
|||
| Datavetenskap Matematik, tillämpad matematik |
|||
|
Mål:
Introduktion till de viktigaste statistiska metoderna och modellerna i bioinformatik och beräkningsbiologi. |
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) En grundkurs i sannolikhetslära, TAMS35, TAMS07 eller TAMS02 och en grundkurs i statistisk teori t. ex. TAMS08, alternativt hela NMAB06 eller hela TAMS19. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Föreläsningar och datorövningar |
|||
| Kursinnehåll: Sannolikhetsteori och statistisk inferens. Poissonprocesser och markovkedjor. Analys av en DNA-sekvens. Slumpvandring. Dolda Markovkedjor. Skattnings- och hypotesprövningsmetoder inom bioinformatik. Markovkedjor i kontinuerlig tid. Signifikansberäkningar för BLAST. Evolutionsmodeller, Fylogenetisk inferens. |
|||
| Kurslitteratur: - Warren J. Ewens, Gregory R. Grant, Statistical Methods in Bioinformatics: An Introduction. Springer 2001. - Material från kursens hemsida. Hemsida: http://www.mai.liu.se/~tikos/kurser/TAMS23/ |
|||
| Examination: | |||
| TEN2 LAB1 |
En skriftlig tentamen (U,3,4,5) Datorlaboration (U, G) |
3,5 p 0,5 p |
|
Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: MAI.
Studierektor: Eva Enqvist
Examinator: Timo Koski
Länk till kurshemsida på kursgivande institution
Ansvarig utbildningsnämnd: UND
Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2005 enligt beslut av ansvarig utbildningsnämnd.
 |
||||||
| ||||||