| TDDC12 |
Datavetenskapliga och matematiska metoder i bioinformatik, 5 p
/Computational and Mathematical Methods in Bioinformatics/ |
||
Prel. schemalagd
tid: 56 |
|||
|
Utbildningsområde: Teknik Ämnesgrupp: Datalogi, Matematik Nivå (A-D):C |
|||
| Datavetenskap Datavetenskap, datalogi. |
|||
|
Mål:
Kursen ger ett översikt över valda delar av bioinformatiken med ett fokus på datavetenskapliga och matematiska metoder. |
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Grundläggande kunskaper inom cellbiologi (t.ex. TFBI17 Bioteknisk biokemi eller TFBI10 Cellbiologi). Grundläggande kunskaper inom programmering. Databaser (t.ex. TDDB38 eller TDDB77) OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Föreläsningarna behandlar både teori och metodik. I uppgiftsdelen tillämpas teorin och skrivs rapporter inom kursens område. |
|||
| Kursinnehåll: Metoder för lagring, hantering samt analys av biologisk data för användning av DNA analys och studier av proteiners struktur och funktion. Följande kan ingå: Biologiska databanker. Datamodellering. Principer för lagring: text, semi-strukturerad data, databaser. Databanksökning. Sekvensanalys och alignment. Mönster i DNA-sekvenser. Statistiska modeller för biologiska sekvenser. Modellering och förutsägelse av proteinstruktur och proteinveckning. Data mining. Teoretiska och matematiska modeller för biologiska processer. Visualisering. Fylogenetiska rekonstruktioner (släktträd). |
|||
| Kurslitteratur: artikelsamling 2004 |
|||
| Examination: | |||
| UPG1 |
Inlämningsuppgifter (U,G) |
5 p |
|
| Endast betygen Godkänd/Underkänd ges på kursen. | |||
Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: IDA.
Studierektor: Patrick Lambrix
Examinator: Patrick Lambrix
Ansvarig utbildningsnämnd: UND
Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2004.
 |
||||||
| ||||||