| TVCB12 |
Genome Analysis, 6 hp
/Genome Analysis/
För:
KeBi
TB
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 51
Rek. självstudietid: 109
|
| |
Utbildningsområde: Naturvetenskap
Huvudområde: Teknisk biologi Nivå (G1,G2,A): A
|
| |
Mål:
IUAE-matris
I denna kurs kommer studenten att förvärva fördjupade teoretiska och metodologiska kunskaper i genomanalys samt molekylära mekanismer involverade i monogen och polygen nedärvning av egenskaper och för uppkomst av sjukdomar. I ett laborativt projekt kommer studenten med hjälp av avancerade laborativa metoder, bioinformatik och tolkning av resultat att studera strategier för identifiering av gener relaterade till sjukdomar. Studenten kommer också att få kunskap inom molekylär epidemiologi och om hur genetisk variation i populationer påverkar den genetiska predispositionen för sjukdomar. Vid genomgången kurs ska studenten kunna:
Kunskap och förståelse
- Förstå och integrera kunskap om de molekylärgenetiska mekanismerna involverade i monogena och polygena sjukdomar
- Beskriva samspelet mellan genetiska faktorer och omgivningsfaktorer
- Förklara hur genetisk variation i en population påverkar evolution och populationsgenetik
- Identifiera strategier och förklara den teoretiska grunden bakom metoder som används för att kunna identifiera gener kopplade till sjukdomar
Färdighet och förmåga
- Visa hur beräkning av genetisk association och risk kan genomföras
- Tillämpa datorbaserade metoder för att identifiera sjukdomsgener
- Praktiskt genomföra och förklara teorin bakom utvalda molekylärgenetiska metoder för identifiering av gener
Värderingsförmåga och förhållningssätt
- Tolka experimentella resultat och värdera studier avseende genetisk association och beräkning av risk
- Presentera, värdera och förmedla för- och nackdelar med molekylärgenetiska metoder
- Sammanfatta och värdera vetenskaplig litteratur inom genomanalys
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan)
Genteknik och molekylärgenetik (TB), Genteknik (KeBi)
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Organisation:
Kursen bedrivs med studentcentrerat lärande där Problembaserat Lärande (PBL) är en av de pedagogiska metoder som används. Genom detta betonas studentens utveckling av fritt, livslångt lärande som ett instrument för kritiskt tänkande. Studenterna uppmuntras också att ta ansvar för sitt eget lärande och att söka och värdera information och kunskap och att träna samarbete och en flexibel inställning till olika åsikter och idéer. Undervisningsformerna omfattar föreläsningar, basgruppsarbete, seminarier, demonstrationer och laborationer.
|
| |
Kursinnehåll:
Molekylära mekanismer involverade i monogena och polygena egenskaper och sjukdomar
Identifiering av sjukdomsgener
Omgivningsfaktorers samspel med arvsmassan och påverkan på genuttryck
Genetisk variation i populationer och dess påverkan på genetisk predisposition samt genetisk/molekylär epidemiologi
Beräkning av allelfrekvens, association och risk
Principer för viktiga laborativa molekylärgenetiska metoder samt tolkning av resultat och praktiska färdigheter inom valda metoder
Seminarier om utvalda vetenskapliga artiklar
|
| |
Kurslitteratur:
Strachan, Tom & Read, Andrew P: Human Molecular Genetics, Garland Science, 4th ed, 2010
Article series from The Lancet discussing genetic epidemiology: Lancet 2005; 366: 941-51, Lancet 2005; 366: 1036-44, Lancet 2005; 366: 1121-31, Lancet 2005; 366: 1223-34, Lancet 2005; 366: 1315-23, Lancet 2005; 366: 1397-406, Lancet 2005; 366: 1484-98
Scientific literature within molecular genetics and genome analysis
|
| |
Examination: |
TEN1
BAS1
UPG1
UPG2
|
Skriftlig tentamen (U,3,4,5)
Aktivt deltagande i basgrupper (U,G)
Aktivt deltagande i seminarier (U,G)
Uppgifter (U,G)
|
3 hp
1 hp
1 hp
1 hp
|
| |
|
Inlämningsuppgifter, presentationer, skriftlig tentamen på engelska.
|
|