| TFKE58 |
Tillämpad strukturbiologi, 6 hp
/Applied Structural Biology/
För:
KeBi
PRO
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 12
Rek. självstudietid: 148
|
| |
Utbildningsområde: Teknik
Huvudområde: Kemisk biologi Nivå (G1,G2,A): A
|
| |
Mål:
IUAE-matris
Efter genomgången kurs skall studenten kunna:
- förstå förutsättningar och genomförande av strukturstudier på proteiner och biomolekyler med avancerad metodologi inom kristallografi och NMR
- använda molekylgrafisk datormjukvara inom området för att generera grafiska representationer av proteiner baserat på tredimensionella strukturdata, och använda dessa för att utvärdera strukturella, biofysikaliska, elektrostatiska och dynamiska egenskaper hos proteiner
- förstå, ifrågasätta och tillämpa resultat från strukturbiologiska studier genom att kritiskt utvärdera vetenskaplig litteratur och deponerade strukturdata (speciellt PDB databasen)
- självständigt föreslå, planera och utvärdera forsknings- och utvecklingsprojekt där strukturbiologisk metodologi används
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan)
Biokemi, Proteinkemi och Protein Engineering samt Biomolekylär strukturanalys
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Organisation:
Undervisningen sker i form av föreläsningar, lektioner, seminarier och datorlaborationer (främst molekylgrafik). En stor del av kursen drivs i projektform i grupper om tvÃ¥ studenter. Regelbunden handledning och diskussion kring projekten i smÃ¥grupper ingÃ¥r i kursen (â?Tsk reflektorierâ?T).
Kursen pågår hela vårterminen.
|
| |
Kursinnehåll:
Föreläsningsdelen ger en fördjupad inblick i metodologi och approacher vid strukturstudier av proteiner och biomolekyler och bygger på tidigare erhållen kunskap i kurserna Biostrukturella Mätmetoder och Proteinkemi. Kunskapsinhämtning av föreläsningsdelen och tillämpning av modern molekylgrafisk programvara redovisas i en individuell inlämningsuppgift (UPG1). Den fortsatta delen av kursen bedrivs i tre projekt. I det första projektet (UPG2) föreslås artiklar inom strukturbiologiska nyckelområden av kursledare. Arbetet genomförs i grupper om två studenter. Projektet redovisas muntligt med användning av modern molekylgrafisk programvara för generering av proteinillustrationer, samt skriftligt i form av ett abstract till presentationen. Den muntliga och skriftliga redovisningen bedöms i grupp (UPG2). Det andra projektet (UPG3) är ett fördjupningsprojekt där studenterna tar ökat ansvar för ämnesval och kunskapsurval och presentation, och redovisar i seminarieform (fortfarande i grupper om två). Projektets mål är att lägga grunden för en eller flera projektidéer. Dessa utvecklas och redovisas sedan individuellt i UPG4, där studenterna skriver en forskningsansökan inom ett eget valt område relaterat till UPG2 och UPG3.
|
| |
Kurslitteratur:
Kompendium med utdrag ur referenslitteratur, reviews inom ämnet, samt vetenskapliga artiklar.
|
| |
Examination: |
UPG1
UPG2
UPG3
UPG4
|
Individuell skriftlig inlämningsuppgift (U,G)
Muntlig och skriftlig redovisning av projektuppgift 2 i grupp. (U,G).
Muntlig presentation av projektuppgift 3 i grupp (U,G)
Individuell skriftlig presentation av projektuppgift 4 (U,G)
|
1,5 hp
1,5 hp
1,5 hp
1,5 hp
|
| |
|
På kursen ges betyg Underkänd/Godkänd.
För godkänt betyg ska samtliga provmoment vara godkända.
|