| TBMT19 |
Systembiologisk modellering, 2 hp
/Models in System Biology/
För:
TB
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 18
Rek. självstudietid: 35
|
| |
Utbildningsområde: Teknik
Huvudområde: Bioteknik Nivå (G1,G2,A): G2
|
| |
Mål:
IUAE-matris
Kursen skall ge erfarenhet av matematiskt modellbygge för biologiska system. Efter fullgjord kurs skall deltagaren kunna:
- förklara poängen med matematisk modellering som verktyg inom biologiskt experimentellt arbete; förklara några av de vanligaste fallgroparna
- konstruera en matematisk modell för en klass av biologiska system
- analysera, strukturera och simulera matematiska modeller baserade på differentialekvationer
- använda metoder för strukturerat modellbygge inom systembiologi
- anpassa matematiska modeller till mätdata
- validera matematiska modeller mot mätdata; grundläggande statistiska tester
- använda moderna datorbaserade hjälpmedel för matematiskt modellbygge inom systembiologi
- tillämpa och integrera detta med kunskaper från tidigare kurser
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan)
Grundläggande kunskaper inom matematik, biologi och kemi.
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Påbyggnadskurser
Projektkurser inom TBs inriktningar i åk 4, Modellbygge och Simulering
|
| |
Organisation:
Kursen består av föreläsningar, samt en stor laborationsuppgift med en frivillig förlaboration. Kursen examineras mha två skriftliga duggor samt muntligt besvarande av frågor i labbeskrivning.
|
| |
Kursinnehåll:
Föreläsningar, laborationer och projektarbete behandlar:
- Systembiologi: vad det är, grundläggande arbetssätt, frågeställningar och möjligheter.
- Matematisk modellering. Typer av modeller och deras egenskaper.
- Programvara för matematisk modellering och simulering inom systembiologi.
- Systemidentifiering: anpassning av matematiska modeller till mätdata.
- Validering och användande av matematiska modeller. Felsökning och osäkerhetsanalys
|
| |
Kurslitteratur:
Gunnarâ?Ts Crash Course in Systems Biology. Online-föreläsningar som sammanfattar nyckelbegreppen. Uppgifter och tidigare duggor med svar.
|
| |
Examination: |
UPG1
|
Duggor (U,G)
|
2 hp
|
| |
|
På kursen ges betygen Underkänd/Godkänd.
Om duggan inte godkänts efter ett omduggatillfälle måste en kompletterande uppgift som tillhandahålls av examinator lösas, då motsvarande kunskap krävs för genomförande av kandidatprojektet.
|