| TFKE24 |
Biomolekylär strukturanalys, 5 p
/Biostructural technologies/ |
||
Prel. schemalagd
tid: 60 |
|||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Kemi/kemisk biologi Nivå (A-D):C |
|||
|
Mål:
Den studerande skall efter genomgången kurs besitta grundläggande kunskaper om såväl högupplösande NMR-spektroskopi som röntgenkristallografi i teori och praktik. Kursen utgör en bas för tillämpad strukturanalys av proteiner och biomolekyler inom såväl organisk kemi, biokemi och strukturbiologi. Efter genomgången kurs skall den studerande behärska viktiga begrepp, metoder och teorier för bestämning av molekylers struktur och dynamik, kunna uttyda och bedöma experimentella resultat, kunna kritiskt tillgodogöra sig avancerad litteratur inom biomolekylär strukturanalys, samt kunna välja optimal strategi för lösning av ett givet strukturbiologiskt eller bioorganiskt problem. |
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Genomgången Organisk kemi 2 (NKEB22) eller motsvarande. Genomgången Biokemi 1 (NKEA28) eller mostvarande. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Föreläsningar, lektioner, seminarier, demonstrationer/övningar, duggor. |
|||
| Kursinnehåll: NMR-delen av denna kurs innehåller följande moment: NMR-fenomenet, resonans. Kemiskt shift, spinn-spinn koppling (stark och svag), dipolär koppling, kemiskt utbyte, spinnrelaxation, speciellt nuclear Overhauser effekten, quadropolrelaxation. Dynamisk NMR. Tvådimensionell NMR-spektroskopi, korrelationsexperiment, COSY, NOESY, TOCSY, HSQC. Heteronukleära experiment. Förfarande vid småmolekylär strukturanalys samt strukturbestämning av proteiner. Analys av endimensionella och flerdimensionella NMR-spektra för organiska molekyler samt peptider/proteiner. Instrumentdemonstration/övning. Röntgenkristallografidelen i denna kurs innehåller följande moment: proteinkristallisering, där begrepp såsom enhetscell, asymmetrisk enhet, rymdgrupp, Miller index, Braggs lag och ewaldssfär gås igenom. Vidare behandlas hela förfarandet att utgående från en proteinkristall lösa en proteinstruktur innehållande begrepp såsom upplösning (resolution), elektrontäthetskartor, R-faktor, B-faktor, tungmetallderivatisering och molecular replacement. |
|||
| Kurslitteratur: Nuclear Magnetic Resonance. P. J. Hore. Oxford Science Publications 1995. Kompletterande kompendium. |
|||
| Examination: | |||
| TEN1 LAB1 |
En skriftlig tentamen (U,3,4,5) Laborationskurs inkl duggor (U,G) |
4 p 1 p |
|
Undervisningsspråk är Svenska, enstaka förläsningar på engelska av gästföreläsare.
Institution: IFM.
Studierektor: Stefan Svensson
Examinator: Maria Sunnerhagen
Ansvarig utbildningsnämnd: UNMN
Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2004.
 |
||||||
| ||||||