| TFTB24 |
Bioinformatik-översikt och praktiska tillämpningar, 3 p
/Bioinformatics-Overview and Practical Applications/ |
||
OBS! |
Kursen klassas som kemisk biologi för KB. |
||
Prel. schemalagd
tid: 46 |
|||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Biologi Nivå (A-D):D |
|||
|
Mål:
Kursens mål är att ge basala kunskaper i bioinformatik, närmare bestämt om teorier och praktiska tillämpningar av datorbaserade metoder för analyser av DNA- och proteinsekvenser samt för studier av proteiners strukturer. |
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) TFKE25 Biokemi, TFBI10 Cellbiologi, TVMB06 Mikrobiologi och immunologi, TVCB02 Genteknik och molekylärgenetik eller motsvarande kurser. För I och Ii kurser i åk 3 på bioteknikinriktningen. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Undervisningen består av föreläsningar och datorövningar. En uppsättning biologiska problem i form av inlämningsuppgifter som studenterna förväntas lösa med hjälp av de programvaror som finns tillgängliga på internet. Föreläsningarna syftar till att exemplifiera och komplettera kursinnehållet. De datorbaserade övningarna redovisas skriftligt och kontakten med lärare sker framför allt över datanätet, men även vid schemalagda diskussionstillfällen/seminarier. |
|||
| Kursinnehåll: Datorbaserade metoder för analys av DNA sekvenser och för studier av proteiners struktur. Delmomenten belyser såväl teoretiska modeller som biologiska applikationer av de datorprogram som presenteras. Följande problemområden kommer att behandlas: - Databaser och databassökningar - Sekvensjämförelser (både DNA- och proteinnivå) - Sekvensmönster - Proteiners domäner, sekundärstrukturer och posttranslationella modifieringar - Flersekvensjämförelser alignments och fylogenetisk rekonstruktioner (släktträd) - Proteiners tredimensionella struktur |
|||
| Kurslitteratur: Kurslitteratur finns att hämta på nätet. Vetenskapliga artiklar. |
|||
| Examination: | |||
| UPG1 |
Inlämningsuppgifter (U,G) |
3 p |
|
| På kursen ges endast betygen godkänd och icke godkänd. | |||
Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: IFM.
Studierektor:
Examinator: Bengt Persson
Länk till kurshemsida på kursgivande institution
Ansvarig utbildningsnämnd: UNTB
Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2004.
 |
||||||
| ||||||