| NKED15 |
Proteinkemi, 12 hp
/Protein Chemistry/
För:
Bio
KeBi
Kem
KOS
PRO
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 55
Rek. självstudietid: 265
|
| |
Utbildningsområde: Naturvetenskap
Huvudområde: Kemi, Kemisk biologi Nivå (G1,G2,A): A
|
| |
Mål:
IUAE-matris
Kursen avser att ge fördjupade kunskaper inom följande områden: Proteinkemin, protein engineering, struktur-funktionssamband, proteiners biofysikalisk-kemiska egenskaper och metodologi för karaktärisering av proteiner. Efter väl inhämtad kurs kan man:
- Identifera strukturmotiv och därifrån dra slutsatser om proteiners struktur och funktion.
- Söka information från olika databaser för att visualisera proteinstrukturer och jämföra proteinsekvenser.
- Utifrån detaljerade kemiska och fysikaliska egenskaper dra slutsatser om proteindynamik, struktur och funktion.
- Proteinveckningens grundläggande mekanismer och har en fördjupad förståelse av de faktorer som avgör ett proteins stabilitet.
- Formulera problemställningar inom området, som kan besvaras med experimentell metodik
- Ha ett reflekterande, vetenskapligt förhållningsätt till teorier och experimentella data.
- Arbeta i grupp i projektform på laboratoriet.
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan)
Godkänd Allmän kemi 1, Allmän kemi 2, Organisk kemi 1 och Biokemi 1 eller motsvarande. Genomgången Biokemi 2 eller mostvarande.
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Organisation:
Kursen är uppdelad i olika teori- och projektblock för att ge tillfälle till mera ingående och sammanhängande studier av olika avsnitt. Teoriundervisning sker i föreläsnings- och lektionsform. På lektioner studeras 3-dimensionella strukturer av proteiner liksom datorsimulering av olika strukturer.
Under projektdelen arbetar man med gentekniskt muterade humana proteiner, klonade i bakterier. Ursprunget till de muterade proteinerna kan vara proteiner som muterats av de studerande under en tidigare kurs i genteknik eller proteinvarianter som tillverkats av forskargruppen. Vid karakteriseringen av de muterade proteinvarianterna får grupperna själva utifrån en projektbeskrivning detaljplanera sina experiment. Denna planeringsprocess sker interaktivt genom träffar mellan grupperna och lärare/labhandlerare. Grupperna får sedan självständigt utvärdera sina mätresultat. Erhållna resultat presenteras i en skriftlig rapport på engelska.
|
| |
Kursinnehåll:
Vid teoriundervisningen behandlas olika strukturmotiv hos proteiner som alfadomänstrukturer, alfa/betastrukturer, antiparallella betastrukturer, multifunktionella enzymer, membranproteiner, förutsägelse av proteinstrukturer.
Vidare behandlas fysikalisk-kemiska egenskaper hos proteiner och metodik för studier av dessa. Moment som behandlas är kemiska egenskaper hos polypeptider, protein engineering, fysikaliska interaktioner som bestämmer proteiners egenskaper, bl.a. hydrofobinteraktionens roll, proteinstrukturens flexibilitet, proteiners stabilitet, proteinveckningsmekanismer, interaktion med andra molekyler, enzymkatalys.
Inom projektdelen behandlas fysikaliska.kemiska egenskaper hos proteiner och metodik för studier av dessa samt DNA-igenkännade proteiner och proteiners evolution och ursprung. Biofysikaliska mätmetoder som fluorescencespektroskopi och CD används. Vidare andvänds sekvensanalys och strukturmodullering för resultatanalys.
|
| |
Kurslitteratur:
David Whitford, Proteins Structure and Function, Wiley.
Projektbeskrivning från institutionen.
|
| |
Examination: |
TEN1
PRA1
|
En skriftlig tentamen (U,3,4,5)
Projekt (U,G)
|
6 hp
6 hp
|
| |
|
Uppgifterna på tentamen testar hur väl studenten uppfyller kursens mål. |
|