studiehandbok@lith   Länk till universitetets hemsida
 

Tekniska högskolan vid Linköpings universitet

Länk till universitetets hemsida
 
År : 2004
 
TAMS23 Statistiska metoder i bioinformatik, 4 p
/Statistical Methods in Bioinformatics/

För:   C   D   IT   Mat   TB  

 

Prel. schemalagd tid: 48
Rek. självstudietid: 112

  Utbildningsområde: Naturvetenskap

Ämnesgrupp: Matematik   Nivå (A-D):C

  Mål:
Introduktion till de viktigaste statistiska metoderna och modellerna i bioinformatik och beräkningsbiologi.

  Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan)
En grundkurs i sannolikhetslära, TAMS35, TAMS07 eller delkursen i matematisk statistik inom TTIT46 och en grundkurs i statistisk teori t. ex. TAMS08, alternativt hela NMAB06.

OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.

  Organisation:


  Kursinnehåll:
Sannolikhetsteori och statistisk inferens. Poissonprocesser och markovkedjor. Analys av en DNA-sekvens. Slumpvandring. Dolda Markovkedjor. Skattnings- och hypotesprövningsmetoder inom bioinformatik. Markovkedjor i kontinuerlig tid. Signifikansberäkningar för BLAST. Evolutionsmodeller, Fylogenetisk inferens/Mr Bayes.

  Kurslitteratur:
- Warren J. Ewens, Gregory R. Grant, Statistical Methods in Bioinformatics: An Introduction. Springer 2001. - Material från kursens hemsida. Hemsida: http://www.mai.liu.se/~tikos/kurser/TAMS23/

  Examination:
TEN1
En skriftlig tentamen (U,3,4,5)
4 p
 



Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: MAI.
Studierektor: Eva Enqvist
Examinator: Timo Koski
Länk till kurshemsida på kursgivande institution
Ansvarig utbildningsnämnd: UND

Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2004.


Tekniska högskolan vid Linköpings universitet

Länk till sidans topp


Informationsansvarig: TFK , val@tfk.liu.se
Senast ändrad: 02/25/2004