| TAMS23 |
Statistiska metoder i bioinformatik, 4 p
/Statistical Methods in Bioinformatics/
För:
C
D
IT
Mat
TB
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 48
Rek. självstudietid: 112
|
| |
Utbildningsområde: Naturvetenskap
Ämnesgrupp: Matematik Nivå (A-D):C
|
| |
Mål:
Introduktion till de viktigaste statistiska metoderna och modellerna i bioinformatik och beräkningsbiologi.
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) En grundkurs i sannolikhetslära, TAMS35, TAMS07 eller delkursen i matematisk statistik inom TTIT46 och en grundkurs i statistisk teori t. ex. TAMS08, alternativt hela NMAB06.
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Organisation:
|
| |
Kursinnehåll: Sannolikhetsteori och statistisk inferens. Poissonprocesser och markovkedjor. Analys av en DNA-sekvens. Slumpvandring. Dolda Markovkedjor. Skattnings- och hypotesprövningsmetoder inom bioinformatik. Markovkedjor i kontinuerlig tid. Signifikansberäkningar för BLAST. Evolutionsmodeller, Fylogenetisk inferens/Mr Bayes.
|
| |
Kurslitteratur: - Warren J. Ewens, Gregory R. Grant, Statistical Methods in Bioinformatics: An Introduction. Springer 2001.
- Material från kursens hemsida. Hemsida: http://www.mai.liu.se/~tikos/kurser/TAMS23/
|
| |
Examination: |
TEN1
|
En skriftlig tentamen (U,3,4,5) |
4 p
|
| |
|
|