| TFKE40 |
Tillämpad strukturbiologi, 4 p
/
6 hp
/Applied Structural Biology/
För:
KeBi
PRO
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 60
Rek. självstudietid: 100
|
| |
Utbildningsområde: Teknik
Ämnesgrupp: Kemisk biologi Nivå (A-D):D
Huvudområde: Kemisk biologi Nivå (G1,G2,A): A
|
| |
Mål:
Kursen avser att ge fördjupade kunskaper inom följande områden:
- Förståelse för förutsättningar och genomförande av strukturstudier på proteiner och biomolekyler med avancerad metodologi inom kristallografi, NMR och modellering.
- Omfattande praktisk erfarenhet av olika sätt att grafiskt representera proteiner och biomolekylers strukturella, biofysikaliska, dynamiska och elektrostatiska egenskaper baserat på tredimensionella strukturdata och därtill relaterad experimentell information från NMR och kristallografi.
- Förstå, utvärdera, ifrågasätta och tillämpa strukturbiologiska resultat genom kritiskt studerande av vetenskaplig litteratur och deponerade strukturdata (främst PDB-databasen).
- Föreslå, lägga upp och utvärdera forsknings- och utvecklingsprojekt där strukturbiologiska moment ingår.
- Projektleda och delta i projekt där strukturbiologiska moment ingår.
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Biokemi, Proteinkemi och Protein Engineering samt Biomolekylär strukturanalys
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Organisation: Undervisningen sker i form av föreläsningar, lektioner, seminarier och datorlaborationer (främst molekylgrafik). Föreläsare frÃ¥n bioteknisk industri och forskningsinstitut kommer att gästa kursen med avsikt att belysa strukturbiologins plats inom livsvetenskaplig forskning och utveckling. En stor del av kursen drivs i projektform i grupper om tvÃ¥ studenter. Regelbunden handledning och diskussion kring projekten i smÃ¥grupper ingÃ¥r i kursen (â?Tsk reflektorierâ?T).
|
| |
Kursinnehåll: Föreläsningsdelen ger en fördjupad inblick i metodologi och approacher vid strukturstudier av proteiner och biomolekyler och bygger pÃ¥ tidigare erhÃ¥llen kunskap i kurserna Biostrukturella Mätmetoder och Proteinkemi. Kunskapsinhämtning av föreläsningsdelen redovisas i en individuell kontrollskrivning (KTR1). Den fortsatta delen av kursen bedrivs i tre projekt. I det första projektet (UPG1) föreslÃ¥s artiklar inom strukturbiologiska nyckelomrÃ¥den av kursledare. Arbetet genomförs i grupper om tvÃ¥ studenter. Projektet redovisas muntligt med användning av modern molekylgrafisk programvara för generering av proteinillustrationer, samt skriftligt i form av ett abstract till presentationen. Den muntliga och skriftliga redovisningen bedöms i grupp (UPG1). Det andra projektet (UPG2) är ett fördjupningsprojekt där studenterna tar ökat ansvar för ämnesval och kunskapsurval och presentation, och redovisar i seminarieform (fortfarande i grupper om tvÃ¥). Projektets mÃ¥l är att lägga grunden för en eller flera projektidéer. Dessa utvecklas och redovisas sedan individuellt i UPG3, där studenterna skriver en forskningsansökan inom ett eget valt omrÃ¥de relaterat till UPG1 och UPG2.
|
| |
Kurslitteratur: Kompendium med utdrag ur referenslitteratur, reviews inom ämnet, samt vetenskapliga artiklar.
|
| |
Examination: |
KTR1 UPG1 UPG2 UPG3
|
Individuell kontrollskrivning (U,3,4,5) Muntlig och skriftlig redovisning av projektuppgift 1 i grupp. (U,3,4,5). Muntlig presentation av projektuppgift 2 i grupp (U,G) Individuell skriftlig presentation av projektuppgift 3 (U,3,4,5) |
1,5 hp 1,5 hp 1,5 hp 1,5 hp
|
| |
|
För slutbetyget sammanvävs resultaten från kursmomenten KTR1, UPG1 samt UPG3.
|
|