TATM38 Matematiska modeller i biologi, 4 poäng
/Mathematical Models in Biology/

För: TB3

Utbildningsområde: Naturvetenskap    Ämnesgrupp: Matematik
Fördjupningsnivå: C

Mål:
Matematisk modellering av verkliga processer består av tre viktiga steg: a) formulering av en modell från en verbal beskrivning av kända experimentella relationer b)matematisk analys av en modell: det betyder huvudsakligen lösning av differentialekvationer som uppstår vid formuleringen c) tolkning av matematiska svar i termer av den experimentella situationen. Studenterna ska bemästra både den matematik som behövs och själva modelleringssteget. Den matematik som behövs är element av teori av dynamiska system och av linjära partiella differentialekvationer. Den nödvändiga matematiken presenteras genom att börja med enkla fysikaliska exempel som harmonisk oscillator, matematisk pendel och kontinuitetsekvation. De skall utgöra en intuitiv bas som man kan bygga på för att få förståelse av mer komplicerade dynamiska system. Denna matematik skall användas för att formulera och lösa grundläggande modeller inom populations dynamik, epidemiologi och morphogenesis.

Förkunskaper:
Matematik motsvarande kurserna TATM 72 Analys A, TATM 73 Analys B och TATM31 Algebra M.

Organisation:
Undervisningen ges i seminarieform.

Kursinnehåll:
Element av teorin för ordinära differentialekvationer: Newton ekvationer: harmoniska oscillatorn, pendeln. Andra ordningens linjära ekvationer. Dynamiska system: fasporträtt, linjär stabilitet av jämviktspunkter och Liapunovfunktionen. Konservativa system, rörelseintegraler. Tillämpningar: logistiska ekvationer, Lotka-Volterra ekvationer, modeller av epidemier, kemiska reaktioner. Linjära och icke-linjära rekursiva talföljder (=differensekvationer) i modellering av populationsdynamik. Kontinuitetsekvationen, diffusionsekvationer. Metod att lösa linjära partiella diffusionsekvationer; separation av variabler. Turingmodel av mönster som uppstår skapade i kemiska reaktions-diffusionsekvationer. Morphogenesis.

Kurslitteratur:
Beltrami, E.: Mathematics for dynamic modelling, Academic Press 1987, ISBN 0-12-085555-0.

TEN1En skriftlig tentamen. , 3 p.
UPG1Projektrapporter., 1 p.

Undervisningsspåk är svenska.

Engelsk kursplan

Gäller 1999, beslut av utbildningsnämnden november 1998