| TFKE57 |
Proteomik, 6 hp
/Proteomics/
För:
KeBi
PRO
|
OBS! |
.
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 36
Rek. självstudietid: 124
|
| |
Utbildningsområde: Naturvetenskap
Huvudområde: Kemisk biologi Nivå (G1,G2,A): A
|
| |
Mål:
IUAE-matris
Kursens syfte är att ge en bred kunskap om frågeställningar och metoder inom proteomikområdet. Många av de metodologiska grundprinciperna (gentekniska, biokemiska, analytisk-kemiska och bioinformatiska) har introducerats i tidigare kurser, men här får studenten insikt i hur de används inom ett just nu mycket expansivt forskningsfält: Global proteomkarakterisering med avseende på proteinernas förekomst, funktion, reglering, interaktioner och lokalisering i olika celltyper. Ett avsnitt om transkriptomik ingår också. För godkänd kurs ska studenten kunna
- redogöra för proteomikfältets särart och relevans
- beskriva och diskutera principer för och tillämpningar av moderna metoder och strategier för transkriptom- och proteomanalys
- identifiera proteiner och peptider med hjälp av masspektra och genomdatabaser
- sammanfatta innehållet och tolka budskapet i originallitteratur inom proteomikfältet, samt kritiskt granska densamma
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan)
Proteinkemi, genteknik och biomätteknik. Dessutom rekommenderas grundläggande kunskaper i analytisk kemi och bioinformatik.
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Organisation:
Kursen består av föreläsningar, lektioner med problemlösning och seminarieuppgifter, demonstrationer, och två hemuppgifter.
|
| |
Kursinnehåll:
Kvantitativ mRNA-analys med hjälp av bland annat DNA-mikroarrayer. Flerdimensionella proteinseparationsmetoder (2DGE, MDLC). Identifiering av proteininnehåll i celler m h a enzymatisk klyvning, MS- och MS/MS-analys samt sökning i genomdatabaser. Proteinkvantifiering baserad på bland annat isotopinmärkning och MS. Analys av posttranslationella modifieringar. Analys av proteininteraktioner med affinitietskromatografi, Y2H-metodik och proteinmikroarrayer. Karakterisering av omgivningsberoende förändringar av cellers proteininnehåll för identifiering av t ex sjukdomsmarkörer. Metaproteomik. Human Proteome Atlas.
|
| |
Kurslitteratur:
Twyman, R. M.; "Principles of Proteomics" 2nd edition. Originalartiklar.
|
| |
Examination: |
TEN1
UPG1
UPG2
|
Skriftlig tentamen (U,3,4,5)
Inlämningsuppgifter (U,G)
Redovsining (U,G)
|
4 hp
1 hp
1 hp
|
| |
|
|
|