studiehandbok@lith
 

Tekniska högskolan vid Linköpings universitet

 
 
År : 2017
 
TFKE58 Tillämpad strukturbiologi, 6 hp
/Applied Structural Biology/

För:   KeBi   PRO  

 

Prel. schemalagd tid: 12
Rek. självstudietid: 148

  Utbildningsområde: Teknik

Huvudområde: Kemisk biologi   Nivå (G1,G2,A): A

  Mål:  IUAE-matris
Efter genomgången kurs skall studenten kunna:
  • förstÃ¥ förutsättningar och genomförande av strukturstudier pÃ¥ proteiner och biomolekyler med avancerad metodologi inom kristallografi och NMR
  • använda molekylgrafisk datormjukvara inom omrÃ¥det för att generera grafiska representationer av proteiner baserat pÃ¥ tredimensionella strukturdata, och använda dessa för att utvärdera strukturella, biofysikaliska, elektrostatiska och dynamiska egenskaper hos proteiner
  • förstÃ¥, ifrÃ¥gasätta och tillämpa resultat frÃ¥n strukturbiologiska studier genom att kritiskt utvärdera vetenskaplig litteratur och deponerade strukturdata (speciellt PDB databasen)
  • självständigt föreslÃ¥, planera och utvärdera forsknings- och utvecklingsprojekt där strukturbiologisk metodologi används


  Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan)
Biokemi, Proteinkemi och Protein Engineering samt Biomolekylär strukturanalys

OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.

  Organisation:
Undervisningen sker i form av föreläsningar, lektioner, seminarier och datorlaborationer (främst molekylgrafik). En stor del av kursen drivs i projektform i grupper om tvÃ¥ studenter. Regelbunden handledning och diskussion kring projekten i smÃ¥grupper ingÃ¥r i kursen (â?Tsk reflektorierâ?T).
Kursen pågår hela vårterminen.


  Kursinnehåll:
Föreläsningsdelen ger en fördjupad inblick i metodologi och approacher vid strukturstudier av proteiner och biomolekyler och bygger på tidigare erhållen kunskap i kurserna Biostrukturella Mätmetoder och Proteinkemi. Kunskapsinhämtning av föreläsningsdelen och tillämpning av modern molekylgrafisk programvara redovisas i en individuell inlämningsuppgift (UPG1). Den fortsatta delen av kursen bedrivs i tre projekt. I det första projektet (UPG2) föreslås artiklar inom strukturbiologiska nyckelområden av kursledare. Arbetet genomförs i grupper om två studenter. Projektet redovisas muntligt med användning av modern molekylgrafisk programvara för generering av proteinillustrationer, samt skriftligt i form av ett abstract till presentationen. Den muntliga och skriftliga redovisningen bedöms i grupp (UPG2). Det andra projektet (UPG3) är ett fördjupningsprojekt där studenterna tar ökat ansvar för ämnesval och kunskapsurval och presentation, och redovisar i seminarieform (fortfarande i grupper om två). Projektets mål är att lägga grunden för en eller flera projektidéer. Dessa utvecklas och redovisas sedan individuellt i UPG4, där studenterna skriver en forskningsansökan inom ett eget valt område relaterat till UPG2 och UPG3.

  Kurslitteratur:
Kompendium med utdrag ur referenslitteratur, reviews inom ämnet, samt vetenskapliga artiklar.

  Examination:
UPG1 UPG2 UPG3 UPG4
Individuell skriftlig inlämningsuppgift (U,G)
Muntlig och skriftlig redovisning av projektuppgift 2 i grupp. (U,G).
Muntlig presentation av projektuppgift 3 i grupp (U,G)
Individuell skriftlig presentation av projektuppgift 4 (U,G)
1,5 hp
1,5 hp
1,5 hp
1,5 hp
 
På kursen ges betyg Underkänd/Godkänd.
För godkänt betyg ska samtliga provmoment vara godkända.



Undervisningsspråk är Svenska/engelska.
Institution: IFM.
Studierektor: Magdalena Svensson
Examinator: Lars-Göran Mårtensson
Ansvarig programnämnd: Kemi&Biologi

Engelsk kursplan


Tekniska högskolan vid Linköpings universitet


Informationsansvarig: TFK , val@tfk.liu.se
Senast ändrad: 03/21/2017