| NBID17 |
Genteknik och bioinformatik, 10 p
/Gene Technology and Bioinformatics/ |
||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Biologi Nivå (A-D):D |
|||
|
Mål:
Kursdelen genteknik avser att ge kunskaper och färdigheter inom modern genteknik. Vidare skall den studerande tillägna sig praktiska och teoretiska och praktiska kunskaper om avancerad genteknisk metodik. Bioinformatikdelen avser att ge kunskaper om teorier och pratiska tillämpningar av datorbaserade metoder för analyser av DNA-sekvenser samt för studier av proteiners strukturer. |
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Genomgånget basblock med uppfyllda tröskelkrav (50p godkända varav minst 25p teori) samt genomgången kurs i Molekylär genetik med tillämpningar 10p eller motsvarande. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Kursen är indelad i två ungefär lika stora avsnitt. I. Tillämpad genteknik. Föreläsningar syftar till att förtydliga och komplettera kurslitteraturen. Seminarier. Laborationen är utformad som ett projekt. II.Bioinformatik. Undervisningen består av föreläsningar och datorövningar. Biologiska problem i form av inlämningsuppgifter som lösees med hjälp av programvaror som finns på internet. De datorbaserade övningarna redovisas skriftligt och kontakten med lärare sker framför allt över datanätet, men även vid schemalagda diskussionstillfällen/seminarier. |
|||
| Kursinnehåll: I. Syntes och fördjupning av tidigare inhämtade kunskaper inom genteknik. Större delen av kursen ägnas åt en laboration där olika molekylärbiologiska/gentekniska tekniker tillämpas i en aktuell frågeställning. II. Teori och pratiska tillämpningar av datorbaserade metoder för analys av DNA sekvenser och för studier av proteiners struktur. Databaser och databassökningar. Grundläggande sekvensanalys på DNA- och proteinnivå. Mönster i DNA-sekvenser. Proteiners domäner, sekundärstrukturer och posttranslationella modifieringar. Alignments och fylogenetisk rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner. Simulering av PCR, identifiering av restriktions endonukleaser. |
|||
| Kurslitteratur: Aktuell vetenskaplig litteratur Laborationskompendier För bioinformatikavsnittet finns kurslitteratur finns att hämta på nätet Miesfeld, R.L. 1999. Applied Molecular Genetics. Wiley-Liss. Observera att kurslitteraturen kan komma att behöva ändras! Rekommenderad kompletterande litteratur: Attwood & Parry-Smith. 1999. Introduction to Bioinformatics. Longman. Harlow. Ev. ytterligare litteratur fastställs senare |
|||
| Examination: | |||
| LAB3 UPG3 |
Laborationskurs "Tillämpad genteknik" Inlämningsuppgifter "Bioinformatik" |
5 p 5 p |
|
| På kursen ges endast betygen godkänd och icke godkänd. | |||
Undervisningsspråk är Svenska, vid behov ges delar av kursen på engelska.
Institution: IFM.
Studierektor: Agneta Johansson
Examinator: Per-Eric Lindgren
Länk till kurshemsida på kursgivande institution
Ansvarig utbildningsnämnd: UNMN
Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2003.
 |
||||||
| ||||||