| NKED74 |
Proteinkemi, 10 p
/Protein Chemistry/ |
||
Prel. schemalagd
tid: 46 |
|||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Kemi/kemisk biologi Nivå (A-D):D |
|||
|
Mål:
Kursen avser att ge fördjupade kunskaper inom proteinkemin och protein engineering. Stor vikt läggs vid studiet av sambandet mellan proteinernas strukturella uppbyggnad och biologiska funktion, deras kemiska och fysikaliska egenskaper och hur man med olika metoder kan utnyttja dessa för karaktärisering av proteiners egenskaper. Laborationsdelen ger möjlighet till studier av proteiner med moderna instrument och analysmetoder och att arbeta i mera självständig projektform. |
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Godkänd Allmän kemi (NKEA26), Organisk kemi 1 (NKEA27) och Biokemi 1(NKEA28) eller motsvarande. Genomgången Biokemi 2 (NKEC52) eller mostvarande. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Kursen är uppdelad i olika teori- och laborationsblock för att ge tillfälle till mera ingående och sammanhängande studier av olika avsnitt. Teoriundervisning sker i föreläsnings- och seminarieform med aktivt deltagande av de studerande. På lektioner studeras 3-dimensionella strukturer av proteiner liksom datorsimulering av olika strukturer. Under laborationsdelen arbetar man med gentekniskt muterade humana proteiner, klonade i bakterier. Ursprunget till de muterade proteinerna kan vara proteiner som muterats av de studerande under en tidigare kurs i genteknik (NKEC61) eller proteinvarianter som tillverkats av forskargruppen. Innan preparation sker studeras mutationsstället med hjälp av datorgrafik. Rening och karaktärisering sker med hjälp av moderna separations- och analysmetoder. Dessa analyser sker dels i form av stationslaborationer och dels i projektform. Som laborationshandledning utnyttjas konventionella laborationsbeskrivningar och i en del fall enbart vetenskapliga artiklar, för att ge träning i en mera självständig planering och genomförande av experimenten. Erhållna resultat presenteras i rapporter. |
|||
| Kursinnehåll: Vid teoriundervisningen behandlas olika strukturmotiv hos proteiner som alfadomänstrukturer, alfa/betastrukturer, antiparallella betastrukturer, DNA -igenkännande proteiner, multifunktionella enzymer, nukleotidbindande enzymer, virusstrukturer, antikroppars igenkänning av främmande ämnen, membranproteiner, receptorproteiner, förutsägelse, engineering och design av proteinstrukturer. Vidare behandlas fysikalisk-kemiska egenskaper hos proteiner och metodik för studier av dessa. Moment som behandlas är kemiska egenskaper hos polypeptider, protein engineering, posttranslationell modifiering, proteiners evolution och ursprung, fysikaliska interaktioner som bestämmer proteiners egenskaper, bl.a. hydrofobinteraktionens roll, strukturbestämning med röntgendiffraktion, NMR, CD, proteinstrukturens flexibilitet, proteiners stabilitet, proteinveckningsmekanismer, interaktion med andra molekyler, enzymkatalys. På laborationskursen används metodik som expression av klonade proteiner i bakterier, affinitetskromatografi, SDS-elektrofores, Western blotting, fluorescensmätningar, cirkulär dikroism (CD) mätningar, stopped-flow kinetikmätning, datorsimulering. Lägesspecifikt muterade proteiner renas och karaktäriseras, Stabiliteten undersöks. |
|||
| Kurslitteratur: Branden C. och Tooze J.: Introduction to Protein Structure. Creighton T.E.: Proteins. Structure and Molecular Properties. Laborationskompendier från institutionen. |
|||
| Examination: | |||
| TEN3 TEN4 LAB1 |
En skriftlig tentamen I (U,G,VG) En skriftlig tentamen II (U,G,VG) En laborationskurs (U,G,VG) |
2,5 p 2,5 p 5 p |
|
Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: IFM.
Studierektor: Stefan Svensson
Examinator: Uno Carlsson
Ansvarig utbildningsnämnd: UNMN
Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2006 enligt beslut av ansvarig utbildningsnämnd.
 |
||||||
| ||||||