| TFKE41 |
Proteomik, 4 p
/
6 hp
/Proteomics/ |
||
Prel. schemalagd
tid: 60 |
|||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Kemisk biologi Nivå (A-D):D Huvudområde: Kemisk biologi Nivå (G1,G2,A): A |
|||
|
Mål:
IUAE-matris
Kursens syfte är att ge en bred kunskap om frågeställningar och metoder inom proteomikområdet. Många av de metodologiska grundprinciperna (gentekniska, biokemiska, analytisk-kemiska och bioinformatiska) har introducerats i tidigare kurser, men här får studenten insikt i hur de används inom ett just nu mycket expansivt forskningsfält: Global proteomkarakterisering med avseende på proteinernas förekomst, funktion, reglering, interaktioner och lokalisering i olika celltyper. Ett avsnitt om transkriptomik ingår också. För godkänd kurs ska studenten kunna
|
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Proteinkemi och genteknik. Dessutom rekommenderas grundläggande kunskaper i analytisk kemi och bioinformatik. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Kursen består av föreläsningar, lektioner, demonstrationer, en laboration och två hemuppgifter. |
|||
| Kursinnehåll: Kvantitativ mRNA-analys med DNA-mikroarrayer, SAGE och RNAi. Identifiering och kvantitativ analys av proteininnehåll i celler m h a flerdimensionella separationsmetoder (2DGE, 2DLC), enzymatisk klyvning, MS-analys och sökning i genomdatabaser. Proteinkvantifiering m h a isotopinmärkning och MS. Analys av posttranslationella modifieringar. Karakterisering av omgivningsberoende förändringar av cellers proteininnehåll för identifiering av t ex sjukdomsmarkörer. Analys av proteininteraktioner med affinitietskromatografi, Y2H-analys och proteinmikroarrayer. Strukturproteomik med homologimodellering. |
|||
| Kurslitteratur: Twyman, R. M.; �?�Principles of Proteomics�?�. Originalartiklar. |
|||
| Examination: | |||
|
TEN2
LAB1
UPG4
UPG2
|
Skriftlig tentamen (U,3,4,5) Laborationskurs (U,G) Hemuppgifter med obligatorisk inlämning (U,G) Redovisning av en originalartikel (U,G) |
3 hp 1 hp 1 hp 1 hp |
|
Undervisningsspråk är Engelska.
Institution: IFM.
Studierektor:
Examinator: Karin Enander
Ansvarig programnämnd: Kemi&Biologi
Engelsk kursplan
 |
||||||
| ||||||