| NVCB01 |
Bioinformatik - biologiska tillämpningar, 5 p
/Bioinformatics - Biological Applications/
För:
Bio
|
| |
Prel. schemalagd
tid: 60
Rek. självstudietid: 140
|
| |
Utbildningsområde: Naturvetenskap
Ämnesgrupp: Biologi Nivå (A-D):C
|
| |
Mål:
Kursen avser att ge kunskaper om teorier och pratiska tillämpningar av datorbaserade metoder för analyser av DNA-sekvenser samt för studier av proteiners strukturer.
|
| |
Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Genomgånget basblock med uppfyllda tröskelkrav (50p godkända varav minst 25p teori) samt genomgången kurs i Molekylär genetik med tillämpningar 10p eller motsvarande.
OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande.
|
| |
Organisation: Undervisningen består av föreläsningar och datorövningar. Biologiska problem i form av inlämningsuppgifter som lösees med hjälp av programvaror som finns på internet. De datorbaserade övningarna redovisas skriftligt och kontakten med lärare sker framför allt över datanätet, men även vid schemalagda diskussionstillfällen/seminarier.
|
| |
Kursinnehåll: Teori och pratiska tillämpningar av datorbaserade metoder för analys av DNA sekvenser och för studier av proteiners struktur. Databaser och databassökningar. Grundläggande sekvensanalys på DNA- och proteinnivå. Mönster i DNA-sekvenser. Proteiners domäner, sekundärstrukturer och posttranslationella modifieringar. Alignments och fylogenetisk rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner.
|
| |
Kurslitteratur: För bioinformatikavsnittet finns kurslitteratur finns att hämta på nätet
Rekommenderad kompletterande litteratur:
Attwood & Parry-Smith. 1999. Introduction to Bioinformatics. Longman. Harlow.
Ytterligare förslag på litteratur ges inför kursstart.
|
| |
Examination: |
UPG1
|
Inlämningsuppgifter, presentation av grupparbete samt aktivt deltagande vid seminarier(U,G) |
5 p
|
| |
|
På kursen ges betygen Underkänd/Godkänd. |