| TFKE24 |
Biomolekylär strukturanalys, 5 p
/
7,5 hp
/Biostructural technologies/ |
|||
Prel. schemalagd
tid: 60 |
||||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Kemi/kemisk biologi Nivå (A-D):C Huvudområde: Kemi, Kemisk biologi Nivå (G1,G2,A): A |
||||
|
Mål:
Kursen avser att ge fördjupade kunskaper inom grundläggande teorikunskaper inom NMR-spektroskopi och röntgenkristallografi, vilket utgör en bas för tillämpad strukturanalys av proteiner och biomolekyler inom såväl organisk kemi, biokemi och strukturbiologi. Efter väl inhämtad kurs kan man för båda metoderna:
|
||||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Genomgången Organisk kemi 2 eller motsvarande. Genomgången Biokemi 1 eller mostvarande. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
||||
| Organisation: Föreläsningar, lektioner, seminarier, demonstrationer/övningar, duggor. Enstaka förleäsningar ges på engelska av gästföreläsare. |
||||
| Kursinnehåll: NMR-delen av denna kurs innehåller följande moment: NMR-fenomenet, resonans. Kemiskt shift, spinn-spinn koppling (stark och svag), dipolär koppling, kemiskt utbyte, spinnrelaxation, speciellt nuclear Overhauser effekten, quadropolrelaxation. Dynamisk NMR. Tvådimensionell NMR-spektroskopi, korrelationsexperiment, COSY, NOESY, TOCSY, HSQC. Heteronukleära experiment. Förfarande vid småmolekylär strukturanalys samt strukturbestämning av proteiner. Analys av endimensionella och flerdimensionella NMR-spektra för organiska molekyler samt peptider/proteiner. Instrumentdemonstration/övning. Röntgenkristallografidelen i denna kurs innehåller följande moment: proteinkristallisering, där begrepp såsom enhetscell, asymmetrisk enhet, rymdgrupp, Miller index, Braggs lag och ewaldssfär gås igenom. Vidare behandlas hela förfarandet att utgående från en proteinkristall lösa en proteinstruktur innehållande begrepp såsom upplösning (resolution), elektrontäthetskartor, R-faktor, B-faktor, tungmetallderivatisering och molecular replacement. |
||||
| Kurslitteratur: Nuclear Magnetic Resonance. P. J. Hore. Oxford Science Publications 1995. Kompletterande kompendium. |
||||
| Examination: | ||||
| TEN1 LAB1 |
En skriftlig tentamen (U,3,4,5) Laborationskurs (U,G) |
4 p 1 p |
/ / |
6 hp 1,5 hp |
Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: IFM.
Studierektor: Stefan Svensson
Examinator: Maria Sunnerhagen
Ansvarig programnämnd: Kemi&Biologi
Engelsk kursplan
Kursen bedrivs på ett sådant sätt att både mäns och kvinnors erfarenhet och kunskaper synliggörs och utvecklas.
Planering och genomförande av kurs skall utgå från kursplanens formuleringar. Den kursvärdering som ingår i kursen skall därför genomföras med kursplanen som utgångspunkt.
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2008 enligt beslut av ansvarig programnämnd/fakultetstyrelse.
 |
||||||
| ||||||