| TFKE41 |
Proteomik, 4 p
/
6 hp
/Proteomics/ |
||
Prel. schemalagd
tid: 60 |
|||
|
Utbildningsområde: Naturvetenskap Ämnesgrupp: Kemisk biologi Nivå (A-D):D Huvudområde: Kemisk biologi Nivå (G1,G2,A): A |
|||
|
Mål:
Kursens syfte är att ge en bred kunskap om frågeställningar och metoder inom proteomikområdet. Många av de metodologiska grundprinciperna (gentekniska, biokemiska, analytisk-kemiska och bioinformatiska) har introducerats i tidigare kurser, men här får studenten insikt i hur de används inom ett just nu mycket expansivt forskningsfält: Global proteomkarakterisering med avseende på proteinernas förekomst, funktion, reglering, interaktioner och lokalisering i olika celltyper. Ett avsnitt om transkriptomik ingår också. För godkänd kurs ska studenten kunna
|
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Proteinkemi och genteknik. Dessutom rekommenderas grundläggande kunskaper i analytisk kemi och bioinformatik. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Kursen består av föreläsningar, lektioner, laborationer och hemuppgifter. Laborationerna behandlar tvådimensionell gelelektrofores och homologimodellering. Hemuppgifterna handlar om proteinidentifiering respektive proteininmärkning för MS-baserad kvantifiering. Under lektionerna redovisas och diskuteras originalartiklar. |
|||
| Kursinnehåll: Kvantitativ mRNA-analys med DNA-mikroarrayer, SAGE och RNAi. Identifiering och kvantitativ analys av proteininnehåll i celler m h a flerdimensionella separationsmetoder (2DGE, 2DLC), enzymatisk klyvning, MS-analys och sökning i genomdatabaser. Proteinkvantifiering m h a isotopinmärkning och MS. Analys av posttranslationella modifieringar. Karakterisering av omgivningsberoende förändringar av cellers proteininnehåll för identifiering av t ex sjukdomsmarkörer. Analys av proteininteraktioner med affinitietskromatografi, Y2H-analys och proteinmikroarrayer. Strukturproteomik med homologimodellering. |
|||
| Kurslitteratur: Twyman, R. M.; "Principles of Proteomics". Originalartiklar. |
|||
| Examination: | |||
| TEN1 LAB1 UPG1 UPG2 |
Skriftlig tentamen (U,3,4,5) Laborationskurs (U,G) Hemuppgifter med obligatorisk inlämning (U,3,4,5) Redovisning av en originalartikel (U,G) |
2 hp 1 hp 2 hp 1 hp |
|
Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: IFM.
Studierektor: Stefan Svensson
Examinator: Karin Enander
Ansvarig programnämnd: Kemi&Biologi
Engelsk kursplan
Kursen bedrivs på ett sådant sätt att både mäns och kvinnors erfarenhet och kunskaper synliggörs och utvecklas.
Planering och genomförande av kurs skall utgå från kursplanens formuleringar. Den kursvärdering som ingår i kursen skall därför genomföras med kursplanen som utgångspunkt.
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2008 enligt beslut av ansvarig programnämnd/fakultetstyrelse.
 |
||||||
| ||||||