| TDDB77 |
Databaser och bioinformatik, 4 p
/Databases and Bioinformatics/ |
||
Prel. schemalagd
tid: 48 |
|||
|
Utbildningsområde: Teknik Ämnesgrupp: Datalogi, Datateknik Nivå (A-D):C |
|||
|
Mål:
Kursen ger teoretiska och praktiska kunskaper om principer för lagring och återvinning av information i moderna biologiska databassystem som används inom bioinformatik. |
|||
| Förkunskaper: (gäller studerande antagna till program som kursen ges inom, se 'För:' ovan) Grundkurs i programmering. OBS! Tillträdeskrav för icke programstudenter omfattar vanligen också tillträdeskrav för programmet och ev. tröskelkrav för progression inom programmet, eller motsvarande. |
|||
| Organisation: Föreläsningarna behandlar både teori och metodik. Under laborationerna utförs ett antal programmeringsuppgifter som illustrerar principerna för implementering och utnyttjande av en databas. Under projektet undersöks ett antal välkända biologiska databaser och implementeras ett system som integrerar informationen i dessa databaser. |
|||
| Kursinnehåll: Principer för lagring av information: text, semi-strukturerad data, datamodeller, regler. Text: grundläggande begrepp inom informationsåtervinning (information retrieval), konceptuella modeller, lagringsmodeller, sökmekanismer, rankning. Semi-strukturerad data: konceptuell modell, sökmekanismer. Datamodeller: relationsmodell, objektmodell. Databaser: Principer för och använding av generella databashanteringssystem (DBMS). Metoder för datamodellering och databasdesign. Fysiska databasen. Databasspecifika datastrukturer. Frågespråk. Fleranvändarsystem: transaktioner, samtidighetskontroll, återställning. Integration av biologiska databaser. |
|||
| Kurslitteratur: Elmasri & Navathe, Fundamentals of Database Systems, 4e upplaga, 2004. Artikelsamling 2006. |
|||
| Examination: | |||
| TEN1 LAB1 |
Skriftlig tentamen (U,3,4,5) Laborationskurs och projekt (U,G) |
2 p 2 p |
|
Undervisningsspråk är Svenska.
Institution: IDA.
Studierektor: Patrick Lambrix
Examinator: Patrick Lambrix
Länk till kurshemsida på kursgivande institution
Ansvarig utbildningsnämnd: UNTB
Engelsk kursplan
Om inget annat anges ovan gäller betygsskala enligt avsnitt a8.5 i de gemensamma bestämmelserna.
Kursplanen gäller för 2006 enligt beslut av ansvarig utbildningsnämnd.
 |
||||||
| ||||||