Visa engelsk kursplan

Kursnamn

Bioinformatics - Biological Applications, 5p

Kurskategori Programkurs/Fristående kurs Huvudområde Medicinsk biologi Ämnesområde   Kurskod   OMBINF

Mål

The aim of the course is to provide knowledge about theory and practical applications of computer-based methods for analysing DNA sequences and protein structures.

Kursinnehåll

Theory and practical applications of using computer-based methods for studying biological molecules, such as DNA sequences and protein structures. The different parts of the course cover different types of internet-based tools and programs. The following problem areas will be covered: * Comparasion of sequence data. Basic sequence analysis. * Databases and performing searches in databases. Patterns in DNA-sequences. * Secondary and tertiary structures of proteins. * Alignments. Comparasion of genomes between species. Phylogenetic reconstructions. * Metabolic pathways.

Undervisning/Arbetsformer

The course consists of computer exercises and seminars. For every assignment a number of biological problems are presented, which should be solved by the students by using the internet-based tools and computer programs indicated in the assignment. Lectures by invited researchers will give some theoretical background as well as give examples of the different areas where bioinformatics is used. The computer exercises will be reported by written and/or oral presentations at seminars. The educational method used is problem-based learning (PBL). PBL emphasises the student´s development of free, self-supporting, lifelong learning ability as an instrument for critical inquiry. The students own queries and formulated problems form the basis of PBL. Important is also the student´s ability to take responsibility for his/her own learning, and to seek and evaluate information and knowledge and to train co-operation and flexible attitude to different views and ideas.

Examination

Passed on computer assignments and active participation in seminars. Students, which have not passed on the regular examination occasion, are normally offered four additional opportunities according to this syllabus, one of which is close in time to the first examination occasion. Students who have failed three times on the course or part of the course are entitled to request another examiner at the new examination occasion. Omfattning av omexamination och förnyad bedömning av verksamhetsförlagd utbildning För såväl omexamination som förnyad bedömning av verksamhetsförlagd utbildning gäller att omfattningen skall vara densamma som vid ordinarie examination respektive första bedömningstillfället. Vid underkänt på verksamhetsförlagd utbildning får studenten göra detta moment ytterligare en gång. Tidpunkt för omprövning bedöms i varje enskilt fall men kan ske endast när lärare och handledare finns att tillgå. Anmälan till examination/tentamen Inför varje kurs anges hur anmälan till examination skall gå till. I övrigt tillämpas Föreskrifter rörande examination och examinatorer enligt beslut vid Linköpings Universitet. Antal examinationstillfällen Resurskrävande examinationsformer är begränsade till sammanlagt fem gånger; d vs student som inte godkänts vid ordinarie examinationstillfälle har möjlighet att genomgå provet vid ytterligare fyra tillfällen. Därefter ges inget ytterligare tillfälle. Övriga examinationsformer har studenten rätt gå igenom ett obegränsat antal gånger. Tidpunkten för omexamination skall anges i början av varje termin. Den studerande har rätt att anmäla behov av stöd efter två underkända prov.

Förkunskap

Bachelor of Science in Biomedicine or other related subjects such as Medicine or Biology. At least three years of full-time undergraduate studies in a relevant main subject. For students in the Medical Biology Programme, 160 credits: Passed semester 1 to 5. Obs! To be admitted to courses taught in English you must fulfil the requirement of at least one year of full-time undergraduate studies. Documented knowledge of English equivalent to "Engelska B" is required, or an international proficiency test, e.g. TOEFL, minimum score 550/213.

Betyg

På kursen ges betyget Godkänd eller Underkänd.

Kursbevis

Kursbevis utfärdas av fakultetsstyrelsen för medicinska fakulteten, efter begäran av den studerande. Begäran om kursbevis skall göras på särskild blankett, som finns under adress www.hu.liu.se/org/studentenheten/blanketter, eller kan hämtas på Studentenhetens expedition.

Kurslitteratur

Lista över kurslitteratur fastställs av ansvarig institution/motsvarande

Övrigt

Planering och genomförande av kurs skall utgå från kursplanens formuleringar. Den kursvärdering som skall ingå i varje kurs skall därför behandla frågan om hur kursen överensstämmer med kursplanen. Kursen bedrivs på ett sådant sätt att både mäns och kvinnors erfarenhet och kunskaper synliggörs och utvecklas.

Bioinformatics - Biological Applications Bioinformatics - Biological Applications   Kursgivare är: MEDBIO - Medicinsk biologi             Dnr:   Kurskod: OMBINF           Provkoder: (se förteckning i LADOK)       Ämne: Medicinsk biologi                       Nivå   Utbildningsnivå     Ämneskod   Utbildningsområde   D         Naturvetenskap