Visa engelsk kursplan

KURSPLAN

Bioinformatik, 6hp

Kurskategori Master´s Programme in Statistics and Data Mining Huvudområde Statistik Ämnesområde Statistik - ST1   Kurskod   732A51

Mål

Efter avslutad kurs ska den studerande på en avancerad nivå kunna: - redogöra för begrepp inom molekylärbiologi och ha en primär förståelse för olika tekniker som används för att generera data. - reodgöra för viktiga algoritmer och principer för statistiska modeller som används för analys av högdimensionella molekylära data. - tillämpa några av de viktigaste datorprogrammen inom bioinformatik och statistik på molekylära data-exempel.

Kursinnehåll

Kursen introducerar grundläggande molekylärbiologiska begrepp och hur man analyserar data med bioinformatik och statistik. Mer specifikt innehåller kursen: - Grundläggande molekylärbiologi - Grundläggande likelihood-baserad statistik - Dolda Markovmodeller (HMM) - Konstruktion av DNA-sekvenser - Molekylära markörer, QTL-kartering och associationsanalys - Analys av microarraydata

Undervisning/Arbetsformer

Undervisningen består av föreläsningar och datorövningar. Föreläsningarna ägnas åt presentationer av begrepp och metoder. Datorövningarna ger praktisk erfarenhet av statistisk analys av molekylära genetiska data. Hemarbete och egna studier är ett nödvändigt komplement till kursen. Kursens undervisningsspråk är engelska.

Examination

Skriftliga labrapporter från datorövningarna. En sista skriftlig eller muntlig tentamen. Detaljerad information om examinationen finns i kursens studiehandledning. Studerande som underkänts två gånger på kursen eller del av kursen har rätt att begära en annan examinator vid förnyat examinationstillfälle. Den som godkänts i prov får ej delta i förnyat prov för högre betyg.

Förkunskap

För tillträde till kursen krävs det att den studerande har en kandidatexamen med lägst 90 hp, dvs. 18 månader heltidsstudier, i matematik, tillämpad matematik, statistik, bioinformatik eller datavetenskap. Utöver detta, erfordras kurser på grundnivå i grundläggande statistik och datavetenskap samt Engelska B/6.

Betyg

På kursen ges betyget Väl godkänd, Godkänd eller Underkänd

Kursbevis

Kursbevis utfärdas av filosofiska fakultetsstyrelsen, efter begäran av den studerande. Begäran om bevis ska göras på särskild blankett som finns att hämta på Centrala studerandeexpeditionerna eller via http://www.student.liu.se/examen?l=sv. Blanketten lämnas till Examen

Kurslitteratur

Lista över kurslitteratur fastställs av ansvarig institution/motsvarande

Övrigt

Planering och genomförande av kurs skall utgå från kursplanens formuleringar. Den kursvärdering som skall ingå i varje kurs skall därför behandla frågan om hur kursen överensstämmer med kursplanen. Kursen bedrivs på ett sådant sätt att både mäns och kvinnors erfarenhet och kunskaper synliggörs och utvecklas.

Bioinformatik Bioinformatics   Kursansvarig är: IDA - Institutionen för datavetenskap             Dnr: 2012-01070   Kurskod: 732A51           Provkoder: (se förteckning i LADOK)       Ämne: Statistik                       Nivå   Utbildningsnivå     Ämneskod   Utbildningsområde   A1X   Avancerad       TE   Fastställd av Kvalitetetsnämndens AU 2014-11-18 på delegation av filosofiska fakultetsstyrelsen.